1、 呼吸作用引起的損失

苜蓿在刈割后，晾曬初期植物細胞并未死亡，呼吸作用仍在進行，由于營養(yǎng)物質供應中斷，需消耗自身養(yǎng)分，當水分降低到40%-50%時，細胞逐漸死亡，呼吸作用停止。呼吸損失的大小由干燥條件決定，苜蓿經(jīng)歷生理變化過程的時間越短，呼吸損失越少。研究發(fā)現(xiàn)，在干燥條件良好狀態(tài)下，呼吸作用造成干物質的損失約為2%-8%；而惡劣干燥條件下，這種損失可高達16%。

2、 機械作用造成的損失

在調制和搬運苜蓿干草的過程中，部分嫩枝、葉片易受摟草、搬草、堆垛等一系列機械操作影響，不可避免地會造成部分嫩枝、葉片破碎脫落，在機械作業(yè)整個過程中一般葉片損失約20%-30%，嫩枝損失約6%-10%，但葉片和嫩枝所含可消化養(yǎng)分較多，因此機械損失不僅造成干草產量下降，而且使干草品質降低。

3、 熱害霉變引起的損失

在調制過程中由于草壟較厚（無散草作業(yè)）上下干燥不均勻或打捆含水量較高（大于20%），使草壟下部苜�；虿堇�內部受微生物的活動而引起發(fā)熱、霉變造成的損失。一般當植物體內含水量為25%-40%、氣溫25-30℃時就會滋生微生物，當空氣濕度達到85%-90%時，微生物活動更為活躍，將導致干草的發(fā)霉變質，營養(yǎng)成分大幅下降，甚至完全喪失飼用價值。

4、 淋雨損失

當苜蓿含水量在40%以上時，細胞尚未死亡，陰雨會延長苜蓿的干燥時間，呼吸損失增加；當苜蓿含水量在40%以下進，細胞已經(jīng)死亡，原生質的滲透性增加，雨淋會造成可溶性營養(yǎng)物質的流失，導致苜蓿顔色變白，無干草香味。同時，雨淋還會為微生物的繁殖創(chuàng)造條件而產生熱害或霉變，引起苜蓿營養(yǎng)成分更大的損失，若陰雨連綿導致苜蓿發(fā)熱霉變，營養(yǎng)物質損失甚至可達50%以上。